O brometo de etídio

Por esta técnica de visualização, o brometo de etídio é misturada com pó de agarose, tampão de EDTA e água para formar a matriz de gel, antes da electroforese. Consequentemente, as moléculas de brometo de etídio ficar uniformemente dispersa por toda a matriz. Uma vez que os poços de gel foram cheios com as respectivas amostras de DNA e os corantes de rastreamento, a voltagem é aplicada ao desenhar-se lentamente compostos grandes e polares na matriz.

Durante este movimento, as bases das moléculas de ADN se ligam temporariamente as partículas para o brometo de etídio, arrastando-os juntamente. Com electroforese tempo está completo, cada molécula de DNA recolhidos em quantidades significativas de brometo de etídio.



Na presença de luz ultravioleta, mostra a fluorescência de brometo de etídio. Brilho técnico luz um UV especialmente calibrado através do gel, enquanto uma máquina de captura a imagem dos fragmentos incandescentes.

O azul de metileno

Se uma fonte de UV não está disponível ou prática, os técnicos podem fazer ADN visível em condições normais por imersão do gel de agarose terminado, com o DNA electrophoresized dentro, em uma solução de azul de metileno a noite.

Um sal com um anião cloreto significativamente hidrofóbico, moléculas de azul de metileno penetrar toda a matriz de gel. No entanto, a ligação de hidrogênio em moléculas de DNA causar a acumular mancha. Esta densidade mais elevada em torno do corante de ADN produz um tom de azul profundo, visível a olho nu.

Corantes de rastreamento

Além do tamanho relativo das bandas de ADN, os técnicos podem medir o tamanho absoluto (em pares base) de cada fragmento usando produtos químicos chamados busca corantes. Visíveis sem a adição de azul de metileno ou brometo de etídio, tal como corantes de rastreamento de azul de bromofenol e xileno cianol movimento através das matrizes aragose gel durante a electroforese na mesma velocidade que os fragmentos de ADN que consiste de 300 nucleótidos e 4000 nucleótidos, respectivamente. Na electroforese, os fragmentos de ADN de maior massa que viajam através da matriz de gel a uma velocidade reduzida em comparação com os fragmentos mais pequenos.
Portanto, durante o rastreio de corantes não afectam directamente a visibilidade dos fragmentos de ADN, por comparação da posição de um fragmento de DNA no gel na posição destes corantes permitem aos técnicos "ver" o número aproximado de nucleótidos do fragmento de ADN contém.